Paru pour la première fois en 1802, les Rapports du physique et du moral de l'homme constituent une œuvre originale quant à sa disposition: il s'agit d'un "traité d'Idéologie physiologique, la physiologie devant assurer le fondement des sciences morales" (Laurent Clauzade, 1998).

C'est à travers la connais-sance de la nature humaine, à travers la physiologie, que se révèlent les structures complexes des rapports entre la partie physique et la partie morale. Alors que dans les Rapports l'analyse de ces parties est considérée comme le fondement de toutes les autres sciences, Cabanis applique dans son Coup d'œil sur les révolutions et la réforme de la médecine (1804) le principe idéologique à la médecine, l'analysant dans le cadre des autres branches scientifiques.